【主人公が産まれる前】 主人公が産まれる前、DadとCatherine(母親)、そしてDr. LiたちはProject Purityという 大規模汚染水浄化プロジェクトを行っていた。 Vaultなどにも汚染水を浄化する装置はあるが、Project Purityはもっと大規模に浄化できるので 人類を救うことができるというプロジェクトだった。 しかし、主人公が生まれCatherineは難産で死亡。DadはProject Purityを捨て、主人公を 守って生きていくことを決意した。 Brotherhood of Steelの助けを借りてRivet CityからMegaton、 Vault 101へ移る(このとき助けてくれたBoSのねーちゃんに後で会える)。 このとき初めてVault 101はドアを開け、外部の人間を入れる。 【産まれてから】 主人公が19歳になったとき、Dadはまた裏切ることを - 19年前は人類を、今度はVault 101と 主人公を - 裏切ることを決意、出て行ってしまう。 理由はProject Purityを続けたいから。主人公にはVault 101で安全に育ってほしいと思い 声をかけなかった。かわいそうなJonasはDadに誘われ脱走を決意するが、脱走がばれて撲殺 されてしまう。 各VaultにはそれぞれMissionがあり、Vault 101はDNA汚染の回避(つまり、 外部の人間をいれず、世界が元にもどるまで内部の人間だけで繁栄を続け、 「純粋」な人類の維持計画)だった。しかし、Vault内の人口は減っていっており、 それを知ってか知らずか、Dadは脱走、Overseer激怒、住民混乱、プレーヤーワクテカ。 【ゲーム開始後】 主人公はDadを追ってDC各地を放浪する。 メインクエストに関連するグループの説明だけをすると: Tonnel Snakes:ローカル雑魚チーマー。 Brotherhood of Steel:本拠地は西海岸。DCへは失われたテクノロジーを探しにやってきたが 住民が虐殺されているのを見かねたOwyn Lyons(Elder Lyons)が「人類のために戦う」ことを 決意する。それ以降、いろいろな重要拠点(GNRとかProject Purityとか)を守る。 ただし、Mutant系は敵とみているのか、Ghoulsに対しても発砲する。 Outcaster:Lyonsのぬるいやり方に反対し、もともとのMissionを遂行しようとしているグループ。 どちらかというと、こちらのほうがオリジナルのBrotherhood of Steelに思想は近い。 Enclave:彼らもまたProject Purityを追って活動しているグループ。リーダーは大統領。 Dick Richardsonの死後、ZAXスーパーコンピュータのAIがJohn Henry Edenとなる。 過去大統領の人格を学習していて人間ぽい。Enclaveの目標はVault 101と同じ。 汚染されているDNAの消去。「純粋」な人間のみ残したいため、Project PurityにFEVに 反応するウイルス?を入れたがっている。 Ghouls/Super Mutants:彼らは「放射能汚染」によって突然変異したわけではなく、 FEV(Forced Evolutionary Virus)によってあのようになった。Vault 87はFEVの実験施設。 【その他用語】 FEV:上記参照 GECK:Garden of Eden Creation Kitの略。Wastelandの死滅した土地を再び再生することが できる機械。Future-Tecが作成。 (以下英語WIKIから概訳)Fallout、Fallout2ではGECKはサバイバルキットだったが、 Fallout3ではBraunの設計どおりに作成されたテラフォーミング用キットとして扱われている。